Jedná se především o vyšetření endoskopická (gastroskopie, koloskopie, sigmoideoskopie, endosonorafie), vyšetření funkční (pH-metrie), z dalších invazivních vyšetření pak jaterní a ledvinná biopsie.
Endoskopická vyšetření:
- Gastroskopie
- Enteroskopie
- Koloskopie
- Sigmoideoskopie
- Rektoskopie
- Polypektomie
- Drenážní výkony
- Endoskopická retrográdní cholangiopankreatikografie (ERCP)
- Endosonografie
- Rektální endosonografie
- Perkutánní endoskopická gastrostomie (PEG)

