Lůžková část:
IGEK standardní oddělení A - 15. podlaží lůžkového traktu (vč. nadstandardního pokoje)
IGEK standardní oddělení B - 15. podlaží lůžkového traktu
IGEK Jednotka intenzivní metabolické péče (JIMP) - 15. podlaží lůžkového traktu
IGEK Jednotka intenzivní péče (JIP) - 15. podlaží lůžkového traktu
Ambulantní část:
Akutní příjmové ambulance (interní i gastroenterologická) - přízemí pavilonu I1 (spojovací chodba mezi pavilonem X a lůžkovým traktem - přístup vchodem do pavilonu X vlevo za lékárnou)
Alergologické ambulance - pavilon C, stará zástavba
Centrum domácí parenterální výživy - 15. podlaží lůžkového traktu
Diabetologické centrum - pavilon X (DTC), -1. podlaží
Hemodialyzační středisko - 6. nadzemní podlaží lůžkového traktu
Nefrologické ambulance - 6. nadzemní podlaží lůžkového traktu
Denní stacionář Centra pro nespecifické střevní záněty a biologickou terapii - 15. podlaží lůžkového traktu
Endokrinologické ambulance - pavilon X (DTC), -1. podlaží
Endoskopické centrum - pavilon Z, 5. podlaží
Gastroenterologické specializované poradny - pavilon X (DTC), -1. podlaží
Poradna Centra pro nespecifické střevní záněty a biologickou terapii - přízemí pavilonu I1 (spojovací chodba mezi pavilonem X a lůžkovým traktem - přístup vchodem do pavilonu X vlevo za lékárnou)
Klinická psychologie - pracovna psychologa v 15. podlaží lůžkového traktu v prostoru lůžkového oddělení B
Nutriční poradna - pavilon CH, přízemí