Prevence a kontrola infekcí je řešena Oddělením kontroly infekcí a nemocniční hygieny v úzké spolupráci s Oddělením klinické mikrobiologie a imunologie.
Pracovníci obou oddělení jsou také členy Komise pro prevenci a kontroly infekcí v přímé podřízenosti ředitele FN Brno, vzniklé podpisem statutu 28. ledna 2013.