Ústav patologie se nachází v pavilonu I1 a těsně navazuje na hlavní výškovou budovu lůžkového traktu.
Vedení ústavu a laboratoře jsou umístěny v 2.NP
Autoptický provoz je v suterénu budovy. Vstup pro pohřební služby je v přízemí budovy I, blíže k pavilonu X.

