Lůžkovou část tvoří dvě standardní oddělení a jednotka intenzivní péče.
Celkový počet lůžek kliniky: 60
| JIP 52 | 11 intenzivních lůžek |
| operační sálek, převažují těžké neuroinfekce a septické stavy |
| oddělení 54 | 23 lůžek |
|
specializovaná lůžková část, boxový systém zaměření na volatilní |
| oddělení 40 | 26 lůžek |
| standardní lůžková část specializovaná na infekční onemocnění GIT |