Prioritní úlohou této sekce je zavádění nových technologií funkční genomiky a proteomiky do biomedicínského, převážně onkologického výzkumu s výhledem na jejich perspektivní využití v klinické diagnostice.
Uvítáme kontakty entuziastických zájemců o případnou spolupráci či působení na našem pracovišti.
 |
Vedoucí sekce:
prof. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D.
+420-532234622
+420-604231908
Nabízíme možnost analýzy DNA a proteinových čipů.
Spolupráce
Pracovní kolektiv
|
RNDr. Jitka Kabátová |
532234188 |
|
|
Mgr. Barbara Kantorová – PGS |
532234207 |
|
|
Mgr. Kateřina Staňo-Kozubík, Ph.D. |
532234702 |
|
|
PharmDr. Jana Lochmanová – PGS |
532234188 |
|
|
RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D. |
532234396 |
|
|
MUDr. Mgr. Marek Mráz – PGS |
532234206 |
|
|
Mgr. Šárka Pavlová, Ph.D. |
532234207 |
|
|
Mgr. Karla Plevová – PGS |
532234396 |
|
|
RNDr. Ludmila Šebejová – PGS |
532234188 |
|
|
Mgr. Jana Šupíková – PGS |
532234188 |
|
|
Mgr. Nikola Tom - PGS |
532234641 |
|
|
532234207 |
|
|
|
Ing. Jan Verner, Ph.D. |
532234206 |
|
|
Mgr. Jana Zemanová - PGS |
532234641 |
|
laboranti |
|
|
|
Lenka Juračková – vedoucí laborant |
532234396 |
|
|
Lenka Kociánová |
|
|
|
|
|
|
Grantové projekty
MSM 0021622430 - Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk – identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie (2007-2013), řešitel: Doc. MVDr. Aleš Hampl, CSc.
NS10439 – Analýza změn genomu a jeho exprese u pacientů s chronickou lymfocytární leukémií v průběhu vývoje onemocnění ( 2009-2011), řešitel: Doc. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D.
NS 9858 – Prognostická stratifikace CLL pacientů dle genetických změn v genu TP53 – vyhledávání mutací funkční analýzou a moderními metodami (2009-2011), řešitel: Dr. Martin Trbušek, PhD.
FR-TI2/254 – Real-time PCR soupravy pro diagnostiku v onkologii (2010-2013), řešitel: RNDr. Martin Bunček, Ph.D.
NT11217-5/2010 – Úloha nekanonické Wnt signalizace v molekulární patogenezi chronické lymfocytární leukémie (2010-2014), řešitel: Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D.
NS 9683 – Změny genomu a proteomu u leukemických pacientů s reakcí štěpu proti hostiteli (GvHD) (2009-2011), řešitel: RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.
GAP301/10/0590 - Studium vlivu nukleárních proteinů HMGB na citlivost lidských buněk k protinádorovým léčivům inhibujícím DNA topoizomerázy (2010-2012), řešitel: RNDr. Michal Štros, CSc.
NT 11218 - Funkční a strukturní změny microRNA u lymfoproliferativních malignit a jejich vliv na prognózu onemocnění a predikci léčebné odpovědi (2010-2015), řešitel: Doc. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D.
Vybrané publikace
Trbušek M., Šmardová J., Malčíková J., Šebejová L., Dobeš P., Svitáková M., Vránová V., Mráz M., Skuhrová Francová H., Doubek M., Brychtová Y., Kuglík P., Pospíšilová Š., Mayer J.: Missense Mutations Located in Structural p53 DNA-binding Motifs Are Associated with Extremely Poor Survival in Chronic Lymphocytic Leukemia. J. Clinical Oncology (2011), in press.
Tvarůžková Z., Pavlová Š., Doubek M., Mayer J., Pospíšilová Š.: Lymfoproliferativní onemocnění u pacientů s autoimunitními a infekčními onemocněními: význam antigenní stimulace a zánětlivých procesů. Časopis lékařů českých (2011), 150: 161-168.
Malčíková J., Tichý B., Damborský J., Kabáthová J., Trbušek M., Mayer J., Pospíšilová Š.: Analysis of the DNA-binding aktivity of p53 mutants using functional protein microarrays and its relationship to transcriptional activation. Biological Chemistry (2010); 391: 197-205.
Kotašková J., Tichý B., Trbušek M., Skuhrová Francová H., Kabáthová J., Malčíková J., Doubek M., Brychtova Y., Mayer J., Pospíšilová Š.: High Expression of Lymphocyte - Activation Gene 3 in Chronic Lymphocytic Leukemia Cells is Associated with Unmutated IGHV and Reduced Treatment-Free Survival. Journal of Molecular Diagnostics (2010); 12(3): 328-334.
Mráz M., Pavlová Š., Malčíková J., Malinová K., Mayer J., Pospíšilová Š.: Molekulární patogeneze chronické lymfocytární leukémie. Transfuze a hematologie dnes (2010); 16(Suppl.1): 16-20.
Malčíková J., Pospíšilová Š., Mayer J., Trbušek M.: Význam nádorového supresoru p53 u chronické lymfocytární leukemie. Transfuze a hematologie dnes (2010); 16(Suppl.1): 29-32.
Mráz M., Pospíšilová Š., Mayer J.: MikroRNA v patogenezi chronické lymfocytární leukémie a jejich prognostický význam. Transfuze a hematologie dnes (2010); 16(Suppl.1): 33-35.
Staňo-Kozubík K, Malčíková J, Tichý B, Kotašková J, Borský M, Hrabčáková V, Francová H, Valášková I, Bourková L, Šmardová J, Doubek M, Brychtová Y, Pospíšilová Š, Mayer J, Trbušek M.: Inactivation of p53 and amplification of MYCN gene in a terminal lymphoblastic relapse in a chronic lymphocytic leukemia patient. Cancer Genet Cytogen (2009); 189(1):53-58.
Mráz M, Malinová K, Kotašková J, Pavlová Š, Tichý B, Malčíková J, Staňo-Kozubík K, Šmardová J, Brychtová Y, Doubek M, Trbušek M , Mayer J, Pospíšilová Š.: miR-34a, miR-29c and miR-17-5p are downregulated in CLL patients with TP53 abnormalities. Leukemia (2009); 23(1): 1159-1163
Čejková S, Ročňová L, Potěšil D, Šmardová J, Nováková V, Chumchalová J, Žežulková D, Borský M, Doubek M, Brychtová Y, Pospíšilová Š, Klabusay M, Mayer J, Trbušek M.: Presence of heterozygous ATM deletion may not be critical in the primary response of chronic lymphocytic leukemia cells to fludarabine. Eur J Haematol (2009); 82(2):133-42. Epub 2008 Nov 6
Mráz M, Pospíšilová Š, Malinová K, Šlapák I, Mayer J.: MicroRNAs in chronic lymphocytic leukemia pathogenesis and disease subtypes. Leuk Lymphoma (2009 Mar); 50(3): 506-9
Mráz M., Malinová K., Mayer J., Pospíšilová Š.: MicroRNA isolation and stability in stored RNA samples. Biochemical and Biophysical Research Communication (2009); 390(1): 1-4
Malčíková J., Šmardová J., Ročňová L., Tichý B., Kuglík P., Vranová V., Čejková S., Svitáková M., Skuhrová Francová H., Brychtová Y., Doubek M., Brejcha M., Klabusay M., Mayer J., Pospíšilová Š., Trbušek M.: Monoallelic and biallelic inactivation of TP53 gene in chronic lymphocytic leukemia: selection, impact on survival, and response to DNA damage. Blood. 2009 Dec 17;114(26):5307-14. Epub 2009 Oct 22.
Pospíšilová Š., Tichý B., Mayer J.: Sekvenování lidského geonomu technologie nové generace aneb budeme rutinně sekvenovat lidské geonomy? Časopis lékařů českých (2009); 148(7): 296-302.
Malčíková J, Šmardová J, Peková S, Čejková S, Kotašková J, Tichý B, Francová H, Doubek M, Brychtová Y, Janek D, Pospíšilová Š, Mayer J, Dvořáková D, Trbušek M.: Identification of somatic hypermutations in the TP53 gene in B-cell chronic lymphocytic leukemia. Mol Immunol. 2008 Mar; 45(5):1525-9.
Meluzín J, Vlašín M, Groch L, Mayer J, Křen L, Raušer P, Tichý B, Horňáček I, Sitar J, Palša S, Klabusay M, Kořístek Z, Doubek M, Pospíšilová S, Lexmaulová L, Dušek L. Intracoronary Delivery of Bone Marrow Cells to the Acutely Infarcted Myocardium. Optimization of the Delivery Technique.Cardiology. 2008 Jun 27;112(2):98-106. [Epub ahead of print]
Svoboda M, Izakovicova Holla L, Sefr R, Vrtková I, Kocaková I, Tichý B, Dvořak J. Micro-RNAs miR125b and miR137 are frequently upregulated in response to capecitabine chemoradiotherapy of rectal cancer. Int J Oncol. 2008 Sep;33(3):541-7.
Beneš P., Vashishta A., Saraswat-Ohri S., Fusek M., Pospíšilová Š., Tichý B., Větvička V.: Effect of procathepsin D activation peptide on gene expression of breast cancer cells. Cancer Letters 2006; 239: 46-54.
Kusenda B., Mráz M., Mayer J., Pospíšilová Š.: MicroRNA Biogenesis, Functionality and Cancer Relevance. Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub. 2006; 150 (2): 205-215.
Kusenda B., Pospíšilová Š.: RNA interferencia – nový nástroj génovej terapie. Neurol. pro praxi 2006; 2: 69-71.
Malčíková J., Tichý B., Kotašková J., Mayer J., Pospíšilová Š.: Od genomu k proteinu – využití proteinových čipů v onkologii. Klinická onkologie 2006;19(S): 346-350.
Svoboda M., Vášová I., Kotašková J., Fabián P., Tichý B., Berkovcová J., Klabusay M., Rejhart A.: Aplikace DNA čipů u lymfoidních malignit. Klinická onkologie 2006;19(S): 389-396.
Tichý B., Svoboda M., Mayer J., Pospíšilová Š.: Odběr a zpracování vzorků pro expresní DNA čipy. Klinická onkologie 2006;19(S): 350-354.
Trbušek M., Malčíková J., Šmardová J., Kuhrová V., Mentzlová D., Francová H., Bukovská S., Svitáková M., Kuglík P., Linková V., Doubek M., Brychtová Y., Začal J., Kujíčková J., Pospíšilová Š., Dvořáková D., Vorlíček J., Mayer J.: Inactivation of p53 and deletion of ATM in B-CLL patients in relation to IgVH mutation status and previous treatment. Leukemia 2006; 20:1159-1161.
Pospíšilová Š., Mayer J.: DNA čipy – moderní metodika analýzy diferenciální genové exprese a její význam pro diagnostiku a léčbu nádorových onemocnění. Časopis lékařů českých 2005; 144(1): 11-17.
Štruncová S., Borská R., Kusenda B., Mejstřík P., Dvořáková D., Mayer J., Pospíšilová Š.: RNA interference – účinný nástroj regulace genové exprese. Biologické listy 2005; 70 (3): 231-247.
Pospíšilová Š., Brázda V., Kuchaříková K., Luciani M.G., Hupp T.R., Skládal P., Paleček E., Vojtěšek B.: Activation of the DNA-binding ability of latent p53 protein by protein kinase C is abolished by protein kinase CK2. Biochemical J. 2004; 378: 939-947.
Pospíšilová Š., Siligan C., Ban J., Jug G. and Kovar H.: Constitutive and DNA damage inducible activation of pig3 and MDM2 genes by tumor-derived p53 mutant C277Y. Mol Cancer Res 2004; 20(5): 296-304.
Štros M., Muselíková-Polanská E., Pospíšilová Š. and Strauss F.: Specific recognition of hemicatenated DNA loops by tumor suppressor protein p53. Biochemistry 2004; 43: 7215-25.
