V květnu 2006 získala IKK certifikát systému managementu jakosti – ISO 9001:2000, který je platný na rozsah činností a služeb:
Diagnostika a léčba pacientů s onemocněním vnitřních orgánů a srdečně-cévního systému, poskytování pre- a postgraduálního vzdělávání v oboru vnitřního lékařství a kardiologie a výzkum v oblasti kardiovaskulárního systému.
