Patologie je základním diagnostickým morfologickým oborem, který v součinnosti se všemi klinickými obory zásadním způsobem přispívá ke stanovení diagnózy. Jakýkoliv vzorek odebrané tkáně, orgánu nebo orgánového komplexu je patologem podrobně makroskopicky popsán a po laboratorním zpracování posouzen také mikroskopickým vyšetřením, jehož výsledkem je morfologická diagnóza, která určuje další léčebný postup. Mikroskopickým vyšetřením vzorků pacientů určujeme charakter jejich chorobného procesu, dokážeme odlišit zánětlivý proces od nádorového a určit, jde-li o nádor nezhoubný, nebo zhoubný. Tento proces se označuje jako biopsie. Standartní bioptické (histologické) vyšetření trvá v průměru 3–7 dní. Pokud je nutno provést další vyšetření histochemická nebo imunohistochemická, je výsledek zaslán na klinická oddělení cca do 14 dnů. Za situací, kdy je nutné tento proces zkrátit, například při některých operacích, provádíme biopsie peroperační, kdy je laboratorní zpracování vzorku zkráceno na několik minut a diagnózu hlásíme operujícímu lékaři cca za 30 minut. Další důležitou činností jsou vyšetření cytologická, kdy se diagnóza stanovuje nikoliv na základě vyšetření tkáně, ale pouze buněk. Provádíme cytologická vyšetření tekutin získaných punkcí, výplachy, stěry. Patologie provádí také patologicko-anatomické pitvy. Jejich cílem je makroskopickými a následnými mikroskopickými technikami stanovit pitevní diagnózu a porovnat ji s diagnózou klinickou. Případné diskrepance a zajímavé pitevní nálezy jsou diskutovány na klinicko-patologických seminářích